Balík: hinge (0.5.0-2) [debports]

[ Zdroj:  ]

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom hinge

• dep: daligner

  objavovanie lokálneho zarovnania medzi dlhými čítaniami postupností nukleotidov

• dep: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• dep: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

• dep: libc6 (>= 2.7)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Balík nie je dostupný

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: python

  Balík nie je dostupný

• dep: python-colormap

  Balík nie je dostupný

• dep: python-configparser

  Balík nie je dostupný

• dep: python-matplotlib

  Balík nie je dostupný

• dep: python-networkx

  Balík nie je dostupný

• dep: python-numpy

  Balík nie je dostupný

• dep: python-pbcore

  virtuálny balík poskytovaný balíkom python3-pbcore

• dep: python-ujson

  Balík nie je dostupný

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť hinge

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64 (neoficiálny port)	367.3 kB	3,140.0 kB	[zoznam súborov]