パッケージ: tantan (23-1)

[ ソース: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with::biological-sequence

その他の tantan 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

tantan のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	37.9 kB	106.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	34.8 kB	94.0 kB	[ファイル一覧]
armel	34.0 kB	93.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	32.8 kB	73.0 kB	[ファイル一覧]
i386	39.7 kB	105.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	40.2 kB	123.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	40.4 kB	117.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	39.8 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	35.8 kB	106.0 kB	[ファイル一覧]