Paket: spoa (1.1.5-1)

[ Källkod: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andra paket besläktade med spoa

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libspoa1.1.5 (>= 1.1.5)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta spoa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	27,5 kbyte	101,0 kbyte	[filförteckning]