Paket: nast-ier (20101212+dfsg1-6 och andra)

[ Källkod: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Andra paket besläktade med nast-ier

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Hämta nast-ier

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	20101212+dfsg1-6	19,9 kbyte	99,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	20101212+dfsg1-6+b1	20,0 kbyte	148,0 kbyte	[filförteckning]
armel	20101212+dfsg1-6	19,2 kbyte	94,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	20101212+dfsg1-6	19,0 kbyte	90,0 kbyte	[filförteckning]
i386	20101212+dfsg1-6	20,0 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20,3 kbyte	148,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20,7 kbyte	147,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19,8 kbyte	95,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	20101212+dfsg1-6	20,2 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]