Balík: r-bioc-rsamtools (1.30.0-1) [debports]

[ Zdroj:  ]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-rsamtools

• dep: libc6 (>= 2.15)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1)

  Balík nie je dostupný

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: r-api-3.4

  Balík nie je dostupný

• dep: r-base-core (>= 3.4.2-2)

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.1.3)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.6)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.7)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.8)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.15.1)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-cran-bitops

  balík GNU R implementujúci operácie po bitoch

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Stiahnuť r-bioc-rsamtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
m68k (neoficiálny port)	3,206.0 kB	5,170.0 kB	[zoznam súborov]