Balík: khmer (3.0.0~a3+dfsg-8 a iné)

[ Zdroj: khmer  ]

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Značky: Biológia: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, Filtrovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom khmer

• dep: cython3 (>= 0.26.1) [ia64]

  C-Extensions for Python 3

• dep: khmer-common

  common files for the khmer project tools

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.38) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

  Balík nie je dostupný

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie amd64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: python3 [nie sparc64]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.13) [amd64]

  dep: python3 (<< 3.6) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [amd64]

  dep: python3 (>= 3.4~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.9~) [ia64]

• dep: python3-bz2file [nie amd64]

  Balík nie je dostupný

• dep: python3-screed [amd64]

  short nucleotide read sequence utils in Python 3

  dep: python3-screed (<< 1.0) [sparc64]

  dep: python3-screed (>= 1.0) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť khmer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	3.0.0~a3+dfsg-8+b1	7,074.6 kB	41,004.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.1.2+dfsg-9	6,427.6 kB	33,935.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.0+dfsg-5	5,855.3 kB	23,661.0 kB	[zoznam súborov]