Balík: khmer (2.1.2+dfsg-8)

[ Zdroj: khmer  ]

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Značky: Biológia: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, Filtrovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom khmer

• dep: cython3 (>= 0.26.1)

  rozšírenia v jazyku C pre Python 3

• dep: khmer-common

  common files for the khmer project tools

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-bz2file

  Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files

• dep: python3-screed (>= 1.0)

  short nucleotide read sequence utils in Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť khmer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	6,586.5 kB	29,785.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	6,491.9 kB	29,482.0 kB	[zoznam súborov]