Balík: busco (5.5.0-3 a iné)

[ Zdroj: busco  ]

benchmarking sets of universal single-copy orthologs

Assessing genome assembly and annotation completeness with Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO).

 * Automated selection of lineages issued from https://www.orthodb.org/
 * Automated download of all necessary files and datasets to conduct a run
 * Use prodigal for non-eukaryotic genomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom busco

• dep: bbmap

  BBTools genomic aligner and other tools for short sequences

• dep: hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• dep: prodigal

  Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-pandas

  údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“

Stiahnuť busco

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	5.5.0-2	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	5.5.0-3	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	5.5.0-3	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
i386	5.5.0-3	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	5.5.0-3	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	5.5.0-2	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	5.5.0-3	286.0 kB	1,236.0 kB	[zoznam súborov]