Balík: abyss (2.3.5+dfsg-2) [debports]

[ Zdroj:  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6.1 (>= 2.33)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  zdieľaná knižnica SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: make

  nástroj na riadenie kompilácie

• dep: openmpi-bin

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

• dep: openmpi-common

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spoločné súbory

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

Stiahnuť abyss

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3,091.4 kB	12,135.0 kB	[zoznam súborov]