Paketti: abyss (2.3.5+dfsg-2) [debports]

[ Source:  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Muut pakettiin abyss liittyvät paketit

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6.1 (>= 2.33)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 (jaettu kirjasto)

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

Imuroi abyss

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	3,091.4 kt	12,135.0 kt	[tiedostoluettelo]