Paquet : abyss (2.3.5+dfsg-2) [debports]

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assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes

ABySS est un assembleur de séquences de novo parallèles conçu pour les lectures courtes. Il peut servir à assembler des données de séquences de génome ou de transcriptome. La parallélisation est permise par MPI, OpenMP et pthread.

Autres paquets associés à abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitaires supplémentaires de 4.4BSD-Lite

• dep: libc6.1 (>= 2.33)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: make

  utilitaire pour mener la compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

Télécharger abyss

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	3 091,4 ko	12 135,0 ko	[liste des fichiers]