Balík: ltrsift (1.0.2-8)

[ Zdroj: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Porovnávanie, Organizácia dát, use::viewing, x11::application

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  sada nástrojov prístupnosti ATK

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie arm64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  2D vektorová grafická knižnica Cairo

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  všeobecná knižnica na konfiguráciu písiem - dynamické knižnice

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  správa písiem FreeType 2 - zdieľané knižnice

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  knižnica GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  knižnica glib funkcií jazyka C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  knižnica grafického používateľského rozhrania GTK+

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Stiahnuť ltrsift

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	106.7 kB	376.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	90.1 kB	340.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	94.5 kB	275.0 kB	[zoznam súborov]
i386	119.1 kB	447.0 kB	[zoznam súborov]