Paket: ltrsift (1.0.2-8)

[ Quellcode: ltrsift  ]

Nachbearbeitung und Klassifikation von LTR-Retrotransposonen

LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift). Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Benutzer-Schnittstellen: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zweck: Hilfswerkzeug, GUI-Baukasten: GTK, Zweck: use::analysing, use::browsing, Vergleichen, Daten-Organisation, use::viewing, x11::application

Andere Pakete mit Bezug zu ltrsift

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  ATK - Werkzeugsammlung zur Barrierefreiheit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht arm64]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  Generische Schriftkonfigurationsbibliothek - Laufzeit

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Schrift-Engine FreeType 2, Laufzeitbibliothek

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  Bibliothek GDK-PixBuf

• dep: libgenometools0

  Vielseitige Bibliothek für Genomanalysen

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  GLib - Bibliothek von C-Routinen

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  GTK+ - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

• rec: last-align

  Vergleich biologischer Sequenzen für Genome

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	106,7 kB	376,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	90,1 kB	340,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	94,5 kB	275,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	119,1 kB	447,0 kB	[Liste der Dateien]