Paket: ltrsift (1.0.2-8)
Links für ltrsift
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Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.zbh.uni-hamburg.de]
Ähnliche Pakete:
Nachbearbeitung und Klassifikation von LTR-Retrotransposonen
LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift). Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.
Andere Pakete mit Bezug zu ltrsift
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- dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)
- ATK - Werkzeugsammlung zur Barrierefreiheit
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- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [nicht arm64]
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- dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
- 2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo
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- dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)
- Generische Schriftkonfigurationsbibliothek - Laufzeit
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- dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)
- Schrift-Engine FreeType 2, Laufzeitbibliothek
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- dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)
- Bibliothek GDK-PixBuf
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- dep: libgenometools0
- Vielseitige Bibliothek für Genomanalysen
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)
- GLib - Bibliothek von C-Routinen
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- dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)
- GTK+ - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen
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- dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)
- Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes
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- dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)
- Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes
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- dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)
- Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes
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- rec: last-align
- Vergleich biologischer Sequenzen für Genome
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- rec: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
ltrsift herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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amd64 | 106,7 kB | 376,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 90,1 kB | 340,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 94,5 kB | 275,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 119,1 kB | 447,0 kB | [Liste der Dateien] |