Пакет: skewer (0.2.2-6 и другие)

[ Источник: skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Другие пакеты, относящиеся к skewer

• dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.17) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка skewer

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.2.2-6	87,6 Кб	227,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.2.2-6+b1	86,4 Кб	216,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.2.2-6+b2	79,1 Кб	236,0 Кб	[список файлов]
armel	0.2.2-6+b1	75,2 Кб	235,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.2.2-6+b1	75,5 Кб	171,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.2.2-6	83,6 Кб	195,0 Кб	[список файлов]
i386	0.2.2-6+b1	90,2 Кб	231,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	107,3 Кб	387,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	77,5 Кб	187,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.2.2-6	83,4 Кб	209,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.2.2-6+b1	81,5 Кб	242,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	83,7 Кб	235,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84,9 Кб	236,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.2.2-6+b1	80,3 Кб	159,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.2.2-6+b1	76,0 Кб	199,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	98,1 Кб	190,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	75,2 Кб	197,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.2.2-6	86,1 Кб	201,0 Кб	[список файлов]