Пакет: provean (1.1.5+ds-3 и другие)

[ Источник: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Другие пакеты, относящиеся к provean

• dep: cd-hit [не alpha, ia64]

  suite of programs designed to quickly group sequences

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha, ia64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha, ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: ncbi-blast+ [не alpha, ia64]

  поиск первичных биологических последовательностей

Загрузка provean

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-2	51,0 Кб	161,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.1.5+ds-3	51,0 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.1.5+ds-3	44,7 Кб	153,0 Кб	[список файлов]
armel	1.1.5+ds-3	45,4 Кб	152,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.1.5+ds-3	47,3 Кб	152,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	49,6 Кб	133,0 Кб	[список файлов]
i386	1.1.5+ds-3	52,2 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-2	61,8 Кб	228,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	46,8 Кб	153,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	42,0 Кб	128,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.1.5+ds-3	49,5 Кб	222,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	48,5 Кб	218,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.1.5+ds-3	49,2 Кб	153,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.1.5+ds-3	48,1 Кб	113,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.1.5+ds-3	50,3 Кб	141,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	52,0 Кб	152,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	42,2 Кб	1 051,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.1.5+ds-3	49,2 Кб	136,0 Кб	[список файлов]