Paket: provean (1.1.5+ds-3 und andere)

[ Quellcode: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Andere Pakete mit Bezug zu provean

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  Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen

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  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

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• dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

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  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht alpha, ia64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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• dep: ncbi-blast+ [nicht alpha, ia64]

  next generation suite of BLAST sequence search tools

provean herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-2	51,0 kB	161,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.1.5+ds-3	51,0 kB	149,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1.5+ds-3	44,7 kB	153,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.1.5+ds-3	45,4 kB	152,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.1.5+ds-3	47,3 kB	152,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	49,6 kB	133,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.1.5+ds-3	52,2 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-2	61,8 kB	228,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	46,8 kB	153,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	42,0 kB	128,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.1.5+ds-3	49,5 kB	222,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	48,5 kB	218,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.1.5+ds-3	49,2 kB	153,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.1.5+ds-3	48,1 kB	113,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.1.5+ds-3	50,3 kB	141,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	52,0 kB	152,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	42,2 kB	1.051,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.1.5+ds-3	49,2 kB	136,0 kB	[Liste der Dateien]