Пакет: libbifrost-dev (1.3.1-1 и другие)

[ Источник: bifrost  ]

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Другие пакеты, относящиеся к libbifrost-dev

• dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1) [не arm64]

  library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

  dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1+b1) [arm64]

Загрузка libbifrost-dev

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.3.1-1	637,5 Кб	5 213,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.3.1-1	588,8 Кб	3 858,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.3.1-1+b1	576,0 Кб	3 803,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.3.1-1	727,4 Кб	5 395,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.3.1-1	612,3 Кб	4 463,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.3.1-1	603,5 Кб	4 167,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.3.1-1	619,4 Кб	4 138,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.3.1-1	1 790,5 Кб	18 705,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.3.1-1	610,5 Кб	4 019,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.3.1-1	536,7 Кб	3 889,0 Кб	[список файлов]