Pakiet: libbifrost-dev (1.3.1-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bifrost  ]

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Inne pakiety związane z libbifrost-dev

• dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1) [nie arm64]

  library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

  dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1+b1) [arm64]

Pobieranie libbifrost-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.1-1	637,5 KiB	5 213,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.1-1	588,8 KiB	3 858,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.1-1+b1	576,0 KiB	3 803,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.3.1-1	727,4 KiB	5 395,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.3.1-1	1 705,5 KiB	17 979,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.1-1	612,3 KiB	4 463,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.3.1-1	603,5 KiB	4 167,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.1-1	619,4 KiB	4 138,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.1-1	1 790,5 KiB	18 705,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.3.1-1	610,5 KiB	4 019,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.3.1-1	536,7 KiB	3 889,0 KiB	[lista plików]