Пакет: igdiscover (0.11-4)

[ Источник: igdiscover  ]

analyzes antibody repertoires to find new V genes

IgDiscover analyzes antibody repertoires and discovers new V genes from high-throughput sequencing reads. Heavy chains, kappa and lambda light chains are supported (to discover VH, VK and VL genes).

Другие пакеты, относящиеся к igdiscover

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: python3-cutadapt

  Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

• dep: python3-matplotlib (>= 1.5.0)

  Python based plotting system in a style similar to Matlab

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-pandas (>= 0.16.2)

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-ruamel.yaml

  Roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-scipy (>= 0.16.1)

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-seaborn (>= 0.9)

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-sqt

  SeQuencing Tools for biological DNA/RNA high-throughput data

• dep: python3-xopen (>= 0.3.2)

  Python3 module to open compressed files transparently

• sug: igdiscover-doc

  analyzes antibody repertoires to find new V genes - doc

• sug: snakemake

  pythonic workflow management system

Загрузка igdiscover

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	35,9 Кб	46,0 Кб	[список файлов]