Paquet : igdiscover (0.11-4)

[ Paquet source : igdiscover  ]

analyzes antibody repertoires to find new V genes

IgDiscover analyzes antibody repertoires and discovers new V genes from high-throughput sequencing reads. Heavy chains, kappa and lambda light chains are supported (to discover VH, VK and VL genes).

Autres paquets associés à igdiscover

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-cutadapt

  Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

• dep: python3-matplotlib (>= 1.5.0)

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: python3-pandas (>= 0.16.2)

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-ruamel.yaml

  Roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-scipy (>= 0.16.1)

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-seaborn (>= 0.9)

  bibliothèque de visualisation de statistiques pour Python 3

• dep: python3-sqt

  SeQuencing Tools for biological DNA/RNA high-throughput data

• dep: python3-xopen (>= 0.3.2)

  Python3 module to open compressed files transparently

• sug: igdiscover-doc

  analyzes antibody repertoires to find new V genes - doc

• sug: snakemake

  pythonic workflow management system

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