Пакет: fastx-toolkit (0.0.14-6)

[ Источник: fastx-toolkit  ]

FASTQ/A short nucleotide reads pre-processing tools

The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for preprocessing short nucleotide reads in FASTA and FASTQ formats, usually produced by Next-Generation sequencing machines. The main processing of such FASTA/FASTQ files is mapping (aligning) the sequences to reference genomes or other databases using specialized programs like BWA, Bowtie and many others. However, it is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files before mapping the sequences to the genome—manipulating the sequences to produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these preprocessing tasks.

Теги: Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к fastx-toolkit

• dep: libc6 (>= 2.17)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgd-graph-perl

  Graph Plotting Module for Perl 5

• dep: libgtextutils0v5

  Gordon Text_utils library

• dep: libperlio-gzip-perl

  module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка fastx-toolkit

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	108,0 Кб	553,0 Кб	[список файлов]