パッケージ: fastx-toolkit (0.0.14-6)

[ ソース: fastx-toolkit  ]

FASTQ/A short nucleotide reads pre-processing tools

The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for preprocessing short nucleotide reads in FASTA and FASTQ formats, usually produced by Next-Generation sequencing machines. The main processing of such FASTA/FASTQ files is mapping (aligning) the sequences to reference genomes or other databases using specialized programs like BWA, Bowtie and many others. However, it is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files before mapping the sequences to the genome—manipulating the sequences to produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these preprocessing tasks.

タグ: 役割: プログラム

その他の fastx-toolkit 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgd-graph-perl

  Graph Plotting Module for Perl 5

• dep: libgtextutils0v5

  Gordon Text_utils library

• dep: libperlio-gzip-perl

  module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

fastx-toolkit のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
arm64	108.0 kB	553.0 kB	[ファイル一覧]