Paquet : fastx-toolkit (0.0.14-6)

[ Paquet source : fastx-toolkit  ]

outils de prétraitement des lectures de nucléotides courts aux formats FASTQ/A

Le kit FASTX est une collection d'outils en ligne de commande pour le prétraitement des lectures de nucléotides courts dans les formats FASTA et FASTQ, habituellement produits par les machines de séquençage. Le principal traitement de ces fichiers FASTA/FASTQ est la cartographie (alignement) des séquences sur des génomes de référence ou autres bases de données à l'aide de programmes spécialisés tels que BWA, Bowtie et de nombreux autres. Cependant, il est parfois plus productif de prétraiter les fichiers FASTA/FASTQ avant d'aligner les séquences avec les génomes de référence ou de manipuler les séquences afin de produire de meilleurs résultats. Le kit FASTX réalise quelques-unes de ces tâches de prétraitement.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à fastx-toolkit

• dep: libc6 (>= 2.17)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgd-graph-perl

  module de tracé de graphe pour Perl 5

• dep: libgtextutils0v5

  Gordon Text_utils library

• dep: libperlio-gzip-perl

  module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	108,0 ko	553,0 ko	[liste des fichiers]