Package: sibsim4 (0.20-5 and others)

[ Source: sibsim4  ]

seqüências de RNA expressadas em alinhamento em um modelo de DNA

O projeto SIBsim4 é baseado no sim4, o qual é uma programa desenhado para alinhar uma seqüência de DNA expressada com uma seqüência genômica, permitindo intrões ("introns"). O SIBsim4 é uma reescrita bastante ampla do código original com as seguintes metas:

 * melhora na velocidade;
 * permite o uso de seqüências de DNA, em escala de cromossomos, grandes;
 * fornece saída mais detalhada sobre tipos de "splices";
 * fornece saída mais detalhada sobre locais polyA;
 * uma miscelânea de limpeza de código e correções.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

Download sibsim4

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.20-5	29.7 kB	73.0 kB	[list of files]
arm64	0.20-5+b1	28.4 kB	85.0 kB	[list of files]
armel	0.20-5	27.5 kB	72.0 kB	[list of files]
armhf	0.20-5	26.2 kB	56.0 kB	[list of files]
i386	0.20-5	30.8 kB	80.0 kB	[list of files]
mips64el	0.20-5	29.3 kB	79.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.20-5	31.9 kB	85.0 kB	[list of files]
riscv64	0.20-5+b1	30.7 kB	65.0 kB	[list of files]
s390x	0.20-5	30.5 kB	77.0 kB	[list of files]