Pacote: sibsim4 (0.20-4)

[ Fonte: sibsim4  ]

seqüências de RNA expressadas em alinhamento em um modelo de DNA

O projeto SIBsim4 é baseado no sim4, o qual é uma programa desenhado para alinhar uma seqüência de DNA expressada com uma seqüência genômica, permitindo intrões ("introns"). O SIBsim4 é uma reescrita bastante ampla do código original com as seguintes metas:

 * melhora na velocidade;
 * permite o uso de seqüências de DNA, em escala de cromossomos, grandes;
 * fornece saída mais detalhada sobre tipos de "splices";
 * fornece saída mais detalhada sobre locais polyA;
 * uma miscelânea de limpeza de código e correções.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::TODO, use::comparing, Busca, Suporta o formato: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

Download de sibsim4

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	29.9 kB	72.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	28.4 kB	72.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	26.6 kB	55.0 kB	[lista de arquivos]
i386	31.0 kB	79.0 kB	[lista de arquivos]