Pacote: poa (2.0+20060928-10 e outros)

[ Fonte: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: scope::utility, works-with-format::plaintext, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a poa

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: blast2

  Pacote não disponível

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download de poa

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.0+20060928-10	49.7 kB	182.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	2.0+20060928-10	52.1 kB	142.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.0+20060928-10	48.1 kB	182.0 kB	[lista de arquivos]
armel	2.0+20060928-10	48.8 kB	181.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2.0+20060928-10	47.0 kB	117.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	2.0+20060928-10	48.1 kB	130.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.0+20060928-10	52.5 kB	149.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	2.0+20060928-9	61.5 kB	204.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	2.0+20060928-10	49.9 kB	181.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	2.0+20060928-10	44.5 kB	125.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.0+20060928-10	49.3 kB	186.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	2.0+20060928-10	55.0 kB	182.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.0+20060928-10	56.6 kB	182.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.0+20060928-10	50.7 kB	118.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.0+20060928-10	54.6 kB	145.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	2.0+20060928-10	54.4 kB	181.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	2.0+20060928-10	46.0 kB	1,079.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	2.0+20060928-10	51.1 kB	133.0 kB	[lista de arquivos]