Paketti: poa (2.0+20060928-10 ja muut)

[ Source: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin poa liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: blast2

  Paketti ei saatavilla

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Imuroi poa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	49.7 kt	182.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.0+20060928-10	52.1 kt	142.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.0+20060928-10	48.1 kt	182.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2.0+20060928-10	48.8 kt	181.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2.0+20060928-10	47.0 kt	117.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	48.1 kt	130.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2.0+20060928-10	52.5 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-9	61.5 kt	204.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	44.5 kt	125.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.0+20060928-10	49.3 kt	186.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	55.0 kt	182.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.0+20060928-10	56.6 kt	182.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.0+20060928-10	50.7 kt	118.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.0+20060928-10	54.6 kt	145.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	54.4 kt	181.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	46.0 kt	1,079.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	2.0+20060928-10	51.1 kt	133.0 kt	[tiedostoluettelo]