パッケージ: poa (2.0+20060928-9 など)

[ ソース: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の poa 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: blast2

  パッケージは利用できません

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

poa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	49.7 kB	182.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.0+20060928-9	52.0 kB	142.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.0+20060928-9+b1	48.3 kB	183.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.0+20060928-9	48.8 kB	137.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.0+20060928-9	46.9 kB	109.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	48.3 kB	130.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.0+20060928-9	52.5 kB	149.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	61.5 kB	204.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	44.6 kB	125.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.0+20060928-9	48.7 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	55.0 kB	182.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.0+20060928-9	56.5 kB	182.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.0+20060928-9	51.9 kB	122.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.0+20060928-9	54.6 kB	145.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	54.4 kB	181.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	46.5 kB	1,079.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.0+20060928-9	51.1 kB	129.0 kB	[ファイル一覧]