Pakiet: poa (2.0+20060928-10 i inne)

[ Pakiet źródłowy: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z poa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: blast2

  Pakiet niedostępny

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie poa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	49,7 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.0+20060928-10	52,1 KiB	142,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.0+20060928-10	48,1 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
armel	2.0+20060928-10	48,8 KiB	181,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.0+20060928-10	47,0 KiB	117,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	48,1 KiB	130,0 KiB	[lista plików]
i386	2.0+20060928-10	52,5 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-9	61,5 KiB	204,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	49,9 KiB	181,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	44,5 KiB	125,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.0+20060928-10	49,3 KiB	186,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	55,0 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.0+20060928-10	56,6 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.0+20060928-10	50,7 KiB	118,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.0+20060928-10	54,6 KiB	145,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	54,4 KiB	181,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	46,0 KiB	1 079,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.0+20060928-10	51,1 KiB	133,0 KiB	[lista plików]