Pacote: blixem (4.44.1+dfsg-3)

[ Fonte: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Etiquetas: Kit de ferramentas de interface: GTK

Outros pacotes relacionados a blixem

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  Kit de ferramenta de acessibilidade ATK

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  biblioteca gráfica de vetores 2D Cairo

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2)

  biblioteca de transferência de URL do lado cliente de fácil uso (versão com OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  biblioteca genérica de configuração de fontes - tempo de execução

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  mecanismo de fontes FreeType 2, biblioteca compartilhada

• dep: libgbtools0

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [não armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  biblioteca de Pixbuf GDK

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  biblioteca GLib de rotinas C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0)

  biblioteca de interface gráfica de usuário GTK+

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  layout e renderização de texto internacionalizado

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de blixem

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	342.2 kB	1,147.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	314.0 kB	1,115.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	292.9 kB	739.0 kB	[lista de arquivos]
i386	362.8 kB	1,285.0 kB	[lista de arquivos]