Balík: anfo (0.98-7)

[ Zdroj: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Ostatné balíky súvisiace s balíkom anfo

• dep: libanfo0

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.27)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  knižnica na syntaktickú analýzu parametrov na príkazovom riadku

• dep: libprotobuf17

  knižnica Protocol Buffers pre C++

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť anfo

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	115.6 kB	450.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	107.7 kB	410.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	104.5 kB	308.0 kB	[zoznam súborov]
i386	122.0 kB	428.0 kB	[zoznam súborov]