Pakiet: libtfbs-perl (0.7.1+ds-3)
Odnośniki dla libtfbs-perl
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego libtfbs-perl:
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-3.dsc]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds.orig.tar.xz]
- [libtfbs-perl_0.7.1+ds-3.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Steffen Moeller (Strona QA)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [tfbs.genereg.net]
Podobne pakiety:
scanning DNA sequence with a position weight matrix
The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.
If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".
Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>
Inne pakiety związane z libtfbs-perl
|
|
|
|
-
- dep: bioperl
- Narzędzia do obliczeniowej biologii molekularnej, oparte na Perlu
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libdbi-perl
- Interfejs bazodanowy Perl (DBI)
-
- dep: libwww-perl
- Prosty i spójny interfejs do WWW
-
- dep: pdl (>= 1:2.085-1+b1)
- perl data language: Perl extensions for numerics
-
- dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [nie armhf]
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
- dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]
-
- dep: perlapi-5.38.2 [nie armel, armhf]
- pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base
-
- dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf]
- pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base
-
- rec: libgd-gd2-perl
- pakiet wirtualny udostępniany przez libgd-perl
- lub libgd-gd2-noxpm-perl
- pakiet wirtualny udostępniany przez libgd-perl
Pobieranie libtfbs-perl
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
amd64 | 216,5 KiB | 979,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 216,8 KiB | 1 027,0 KiB | [lista plików] |
armel | 217,6 KiB | 979,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 215,8 KiB | 975,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 217,1 KiB | 979,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 216,6 KiB | 1 028,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 217,4 KiB | 1 027,0 KiB | [lista plików] |
s390x | 216,8 KiB | 979,0 KiB | [lista plików] |