[ buster ]
Pakiet źródłowy: tophat (2.1.1+dfsg1-2)
Odnośniki dla tophat
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (Git)
- Śledzenie łatek systemu Debian
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Carlos Borroto (Strona QA)
- Alexandre Mestiashvili (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [ccb.jhu.edu]
Z tego pakietu źródłowego zbudowano następujące pakiety binarne:
- tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
Inne pakiety związane z tophat
|
|
-
- adep: debhelper (>= 11~)
- Programy pomocnicze do debian/rules
-
- adep: libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
-
- adep: zlib1g-dev
- Biblioteka do kompresji danych - pliki deweloperskie
-
- adep: python
- Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
-
- adep: seqan-dev (>= 1.4)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
-
- adep: libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
-
- adep: help2man
- Automatic manpage generator
-
- adep: bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
Download tophat
| Plik | Rozmiar (w KiB) | Suma kontrolna MD5 |
|---|---|---|
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.dsc | 2,1 KiB | 679aac3888efdaae6fc233c73891040b |
| tophat_2.1.1+dfsg1.orig.tar.xz | 341,8 KiB | 9e350c80adba6b6fdc8045ef4e085800 |
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.debian.tar.xz | 18,2 KiB | 5072d66e095477f87ce398ccfd02098f |
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat.git
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (do przeglądania)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat