[ buster ]
Paquet source : tophat (2.1.1+dfsg1-2)
Liens pour tophat
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Dépôt de source Debian (Git)
- Suivis des correctifs pour Debian
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Carlos Borroto (Page QA)
- Alexandre Mestiashvili (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [ccb.jhu.edu]
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
Autres paquets associés à tophat
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- adep: debhelper (>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- adep: libbam-dev
- manipulation d'alignements de séquences de nucléotides au format BAM ou SAM
-
- adep: zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
-
- adep: python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
-
- adep: seqan-dev (>= 1.4)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
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- adep: libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
-
- adep: libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
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- adep: help2man
- Générateur automatique de pages de manuel
-
- adep: bowtie
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
Download tophat
| Fichier | Taille (en ko) | Somme MD5 |
|---|---|---|
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.dsc | 2,1 ko | 679aac3888efdaae6fc233c73891040b |
| tophat_2.1.1+dfsg1.orig.tar.xz | 341,8 ko | 9e350c80adba6b6fdc8045ef4e085800 |
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.debian.tar.xz | 18,2 ko | 5072d66e095477f87ce398ccfd02098f |
- Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat.git
- Dépôt Debian des paquets source (interface web)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat