[ buster ]
Quellcode-Paket: tophat (2.1.1+dfsg1-2)
Links für tophat
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Betreuer:
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- Carlos Borroto (QS-Seite)
- Alexandre Mestiashvili (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [ccb.jhu.edu]
Die folgenden Binärpakete werden aus diesem Quellcode-Paket gebaut:
- tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
Andere Pakete mit Bezug zu tophat
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- adep: debhelper (>= 11~)
- Hilfsprogramme für debian/rules
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- adep: libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
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- adep: zlib1g-dev
- Kompressionsbibliothek - Entwicklung
-
- adep: python
- Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)
-
- adep: seqan-dev (>= 1.4)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
-
- adep: libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
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- adep: help2man
- Automatischer Handbuchseiten-Generator
-
- adep: bowtie
- Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
Download tophat
| Datei | Größe (in kB) | MD5-Prüfsumme |
|---|---|---|
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.dsc | 2,1 kB | 679aac3888efdaae6fc233c73891040b |
| tophat_2.1.1+dfsg1.orig.tar.xz | 341,8 kB | 9e350c80adba6b6fdc8045ef4e085800 |
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.debian.tar.xz | 18,2 kB | 5072d66e095477f87ce398ccfd02098f |
- Quellcode-Depot des Debian-Pakets (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat.git
- Quellcode-Depot des Debian-Pakets (browsable)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat