[ buster ]
ソースパッケージ: tophat (2.1.1+dfsg1-2)
tophat に関するリンク
Debian の資源:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Carlos Borroto (QA ページ)
- Alexandre Mestiashvili (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [ccb.jhu.edu]
以下のバイナリパッケージがこのソースパッケージからビルドされています。
- tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
その他の tophat 関連パッケージ
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- adep: debhelper (>= 11~)
- helper programs for debian/rules
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- adep: libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
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- adep: zlib1g-dev
- 圧縮ライブラリ - 開発キット
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- adep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
-
- adep: seqan-dev (>= 1.4)
- C++ library for the analysis of biological sequences (development)
-
- adep: libboost-system-dev
- Operating system (e.g. diagnostics support) library (default version)
-
- adep: libboost-thread-dev
- portable C++ multi-threading (default version)
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- adep: help2man
- man ページ自動生成プログラム
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- adep: bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
Download tophat
| ファイル | サイズ (単位: kB) | MD5 チェックサム |
|---|---|---|
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.dsc | 2.1 kB | 679aac3888efdaae6fc233c73891040b |
| tophat_2.1.1+dfsg1.orig.tar.xz | 341.8 kB | 9e350c80adba6b6fdc8045ef4e085800 |
| tophat_2.1.1+dfsg1-2.debian.tar.xz | 18.2 kB | 5072d66e095477f87ce398ccfd02098f |
- Debian パッケージソースリポジトリ (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat.git
- Debian パッケージソースリポジトリ (ブラウザで表示可能)
- https://salsa.debian.org/med-team/tophat