Paketti: twopaco (1.0.0+dfsg-1 ja muut)

[ Source: twopaco  ]

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Muut pakettiin twopaco liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, loong64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei alpha, armhf, hppa, i386, ia64, riscv64, sparc64]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ei arm64, loong64, riscv64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [loong64, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [ei alpha, amd64, arm64, ia64, loong64, riscv64, sparc64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.7.0) [sparc64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.8.0) [alpha, ia64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.9.0) [loong64]

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]

  parallelism helper library for C++ - runtime files

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.11.0) [riscv64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.12.0) [arm64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [ei alpha, amd64, arm64, ia64, loong64, riscv64, sparc64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.7.0) [sparc64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.8.0) [alpha, ia64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.9.0) [loong64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi twopaco

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	370.4 kt	1,846.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0.0+dfsg-1	379.3 kt	1,616.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0.0+dfsg-1+b1	352.7 kt	1,589.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0.0+dfsg-1	349.1 kt	1,139.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	392.9 kt	1,688.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0.0+dfsg-1	414.8 kt	1,810.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	398.4 kt	3,195.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	333.2 kt	1,412.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0.0+dfsg-1	330.2 kt	1,969.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	360.6 kt	2,103.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0.0+dfsg-1	370.0 kt	1,972.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0.0+dfsg-1+b1	375.4 kt	1,197.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0.0+dfsg-1	341.1 kt	1,644.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	331.2 kt	3,261.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0.0+dfsg-1	369.3 kt	1,466.0 kt	[tiedostoluettelo]