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Pacotes similares:

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Outros pacotes relacionados a twopaco

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alpha (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 370.4 kB1,846.0 kB [lista de arquivos]
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arm64 1.0.0+dfsg-1+b1 352.7 kB1,589.0 kB [lista de arquivos]
armhf 1.0.0+dfsg-1 349.1 kB1,139.0 kB [lista de arquivos]
hppa (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 392.9 kB1,688.0 kB [lista de arquivos]
i386 1.0.0+dfsg-1 414.8 kB1,810.0 kB [lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 398.4 kB3,195.0 kB [lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 333.2 kB1,412.0 kB [lista de arquivos]
mips64el 1.0.0+dfsg-1 330.2 kB1,969.0 kB [lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 360.6 kB2,103.0 kB [lista de arquivos]
ppc64el 1.0.0+dfsg-1 370.0 kB1,972.0 kB [lista de arquivos]
riscv64 1.0.0+dfsg-1+b1 375.4 kB1,197.0 kB [lista de arquivos]
s390x 1.0.0+dfsg-1 341.1 kB1,644.0 kB [lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 331.2 kB3,261.0 kB [lista de arquivos]
x32 (porte não oficial) 1.0.0+dfsg-1 369.3 kB1,466.0 kB [lista de arquivos]