Pakiet: libvcflib1 (1.0.9+dfsg-1 i inne) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

Inne pakiety związane z libvcflib1

• dep: libc6 (>= 2.29) [nie ia64, riscv64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.33) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [ia64, sparc64]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [nie ia64, sparc64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libwfa2-0 (>= 2.3.2) [riscv64]

  exact gap-affine algorithm (shared library)

Pobieranie libvcflib1

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	181,3 KiB	833,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	137,1 KiB	405,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	153,0 KiB	533,0 KiB	[lista plików]
riscv64 (port nieoficjalny)	1.0.9+dfsg-1	167,7 KiB	377,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	167,4 KiB	406,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	123,4 KiB	1 057,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.3+dfsg-2	149,7 KiB	397,0 KiB	[lista plików]