Pacote: dialign-tx (1.0.2-12)

[ Fonte: dialign-t  ]

alinhador de seqüências múltiplas baseado em segmentos

DIALIGN-TX é uma ferramenta em linha de comando para realizar alinhamento múltiplo de proteínas ou seqüências de DNA. Ele é uma reimplementação completa da abordagem baseada em segmentos incluindo várias novas melhorias e heurísticas que aumenta significativamente a qualidade dos alinhamentos retornados comparado com DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Para alinhamento aos pares, DIALIGN-TX usa um algoritmo de cadeias de segmentos que favorece cadeias de alinhamentos locais de baixa pontuação em detrimento de fragmentos isolados de alta pontuação. Para alinhamentos múltiplos, DIALIGN-TX usa um procedimento voraz (greedy) melhorado que é menos sensível a similaridades de seqüências locais falsas.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::comparing, works-with-format::TODO, Suporta o formato: Texto puro, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-12)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download de dialign-tx

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	75.1 kB	187.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	75.1 kB	171.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	60.7 kB	123.0 kB	[lista de arquivos]
i386	72.4 kB	191.0 kB	[lista de arquivos]