Package: dialign-tx (1.0.2-12)

[ Source: dialign-t  ]

Alineación de secuencias múltiples basada en segmentos

DIALIGN-TX es una aplicación basada en línea de comandos para realizar alineamientos múltiples de proteínas o secuencias de ADN. Es una re-implementación completa del enfoque fundamental que incluye nuevas mejoras y heurísticas que mejoran significativamente la calidad de los alineamientos de la salida, comparado con DIALIGN 2.2 y DIALIGN-T. Para el alineamiento de pares, DIALIGN-TX usa un algoritmo «fragment-chaining» que favorece cadenas de alineamientos locales de baja puntuación frente a los fragmentos aislados de alta puntuación. Para alineamientos múltiples, DIALIGN-TX emplea un procedimiento «greedy» mejorado que es menos sensible a las falsas similitudes entre secuencias locales.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-12)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	75.1 kB	187.0 kB	[list of files]
arm64	75.1 kB	171.0 kB	[list of files]
armhf	60.7 kB	123.0 kB	[list of files]
i386	72.4 kB	191.0 kB	[list of files]