Balík: ncbi-blast+ (2.11.0+ds-1)

[ Zdroj: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ncbi-blast+

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database - zdieľaná knižnica

• dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libpcre3

  knižnica regulárnych výrazov kompatibilná s Perl 5 - dynamické súbory

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: ncbi-data

  platformovo nezávislé dáta sady nástrojov NCBI

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť ncbi-blast+

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	11,027.6 kB	48,457.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	9,952.6 kB	46,144.0 kB	[zoznam súborov]
armel	9,277.9 kB	39,361.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	9,512.3 kB	32,497.0 kB	[zoznam súborov]
i386	11,910.6 kB	47,640.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	8,183.2 kB	53,819.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	8,264.3 kB	52,934.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	11,161.4 kB	59,079.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	9,900.3 kB	48,543.0 kB	[zoznam súborov]