Package: bio-eagle (2.4.1-3 and others)

[ Source: bio-eagle  ]

유전형 코호트 내에서 또는 단계별 참조 패널을 사용하여 하플로타입 단계화

Eagle은 유전형 코호트 내에서 또는 단계별 참조 패널을 사용하여 하플로타입 단계를 추정합니다. Eagle1 알고리즘의 기본 아이디어는 매우 큰 표본 크기에서는 널리 퍼져 있지만 적은 수의 표본에서는 드문 먼 친척들 사이에서 혈통별 신원을 활용, 빠른 점수 방식을 사용하여 단계를 신속하게 호출하는 것 입니다. 대조적으로, Eagle2 알고리즘은 이전 HMM 기반 방법에서 사용된 이배체 Li-Stephens 모델과 유사한 전체 확률 모델을 분석합니다.

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Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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• sug: bio-eagle-examples

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.4.1-3+b3	227.5 kB	654.0 kB	[list of files]
i386	2.4.1-3+b3	253.1 kB	697.0 kB	[list of files]