Package: samtools (1.21-0+exp1)

[ Source: samtools  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

SAM, BAM, CRAM 형식에서 시퀀스 정렬 처리

Samtools는 바이너리 BAM 형식으로 뉴클레오티드 시퀀스 정렬을 조작하는 유틸리티 세트입니다. ascii SAM (Sequence Alignment/Map) 및 CRAM 형식으로 가져오기 및 내보내기를 수행하고, 정렬, 병합, 인덱싱을 수행하며 모든 영역의 읽기를 신속하게 검색할 수 있습니다. 스트림상에서 작동하도록 설계되었으며 원격 FTP 또는 HTTP 서버에서 BAM 또는 CRAM (SAM 아님) 파일을 열 수 있습니다.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to samtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.21)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libncurses6 (>= 6)

  터미널 처리 공유 라이브러리

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  터미널 조작을 위한 저수준의 terminfo 공유 라이브러리

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  압축 라이브러리 - 런타임

• sug: cwltool

  Common Workflow Language reference implementation

Download samtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	657.4 kB	1,295.0 kB	[list of files]