Package: samtools (1.21-0+exp1)

[ Source: samtools  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Samtools è un insieme di utilità che manipolano allineamenti di sequenze di nucleotidi nel formato binario BAM. Importa ed esporta nei formati SAM (Sequence Alignment/Map - allineamento/mappa di sequenze) e CRAM ASCII, effettua ordinamenti, unioni e indicizzazioni e permette di rintracciare letture in qualsiasi regione in modo veloce. È stato progettato per funzionare su flussi di dati ed è in grado di aprire un file BAM o CRAM (non SAM) su un server FTP o HTTP remoto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to samtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.21)

  libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

• dep: libncurses6 (>= 6)

  librerie condivise per la gestione del terminale

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  libreria condivisa di basso livello terminfo per la gestione del terminale

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: cwltool

  implementazione di riferimento di Common Workflow Language

Download samtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	657.4 kB	1,295.0 kB	[list of files]