パッケージ: velvet-long (1.2.10+dfsg1-8)

[ ソース: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

その他の velvet-long 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: velvet

  非常に短いリード用塩基配列アセンブラ

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

velvet-long のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	205.8 kB	1,832.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	186.7 kB	1,990.0 kB	[ファイル一覧]
armel	216.1 kB	2,309.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	193.0 kB	1,350.0 kB	[ファイル一覧]
i386	237.8 kB	2,344.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	193.8 kB	2,440.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	213.6 kB	2,635.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	192.1 kB	1,942.0 kB	[ファイル一覧]