Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9)

[ Source: velvet  ]

Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger - lang version

Velvet er en »de novo«-genomisk assembler som er specielt designet for teknologier til kort læsning, såsom Solexa eller 454, udviklet af Daniel Zerbino og Ewan Birney ved European Bioinformatics Institue (EMBL-EBI), nær Cambridge, i Storbritannien.

Velvet kan i øjeblikket tage korte læsesekvenser, fjerner fejl og fremstiller dernæst unikke »contig'er« i høj kvalitet. Det anvender derefter parvis læseinformation, hvis tilgængelig, til at indhente de gentagne områder mellem contig'erne.

Denne pakke installerer specielle long-mode-versioner af Velvet, som anbefalet i Velvetøvelserne.

Other Packages Related to velvet-long

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: velvet

  Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [not armel, armhf]

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf]

Download velvet-long

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	192.2 kB	1,860.0 kB	[list of files]
arm64	194.5 kB	2,320.0 kB	[list of files]
armel	221.0 kB	2,126.0 kB	[list of files]
armhf	199.7 kB	1,306.0 kB	[list of files]
i386	227.8 kB	2,365.0 kB	[list of files]
mips64el	198.2 kB	2,632.0 kB	[list of files]
ppc64el	221.6 kB	2,635.0 kB	[list of files]
riscv64	274.2 kB	2,032.0 kB	[list of files]
s390x	210.7 kB	2,030.0 kB	[list of files]