パッケージ: fastani (1.33-3)

[ ソース: fastani  ]

Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

その他の fastani 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

fastani のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	103.1 kB	274.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	90.2 kB	282.0 kB	[ファイル一覧]
armel	84.7 kB	233.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	86.5 kB	169.0 kB	[ファイル一覧]
i386	115.5 kB	293.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	101.0 kB	356.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	106.9 kB	346.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	103.2 kB	286.0 kB	[ファイル一覧]