Paquet : fastani (1.33-3 et autres)

[ Paquet source : fastani  ]

Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

Autres paquets associés à fastani

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, riscv64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

Télécharger fastani

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.33-3+b1	110,3 ko	295,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.33-3+b1	94,4 ko	283,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.33-3+b1	88,5 ko	242,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.33-3+b1	90,3 ko	178,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.33-3+b1	117,0 ko	306,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.33-3+b1	103,1 ko	356,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.33-3+b1	111,8 ko	347,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.33-3+b2	104,5 ko	207,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.33-3+b1	109,6 ko	303,0 ko	[liste des fichiers]