パッケージ: fastani (1.33-2 など)

[ ソース: fastani  ]

Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

その他の fastani 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

fastani のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.33-2+b2	100.9 kB	271.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.33-2+b2	91.1 kB	283.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.33-2+b2	85.4 kB	282.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.33-2+b2	87.5 kB	218.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.33-2+b2	112.7 kB	298.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.33-2+b2	101.8 kB	357.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1.33-2+b2	103.4 kB	355.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.33-2+b2	107.2 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.33-2+b2	91.6 kB	279.0 kB	[ファイル一覧]